La historia se centra en la vida de Cónan, 20 años después del fin de la guerra, al ser un niño que nace y es criado en una isla en la postguerra, donde solo quedan pocos lugares donde hay tierra firme, esto a causa del uso de las armas electromagnéticas, las cuales generaron la destrucción casi inmediata de la mitad del mundo, aparte de terremotos que generaron inundaciones que sumieron a la tierra en un mar eterno. Conan fue cuidado desde su niñez por su abuelo, ya que sus padres murieron cuando era muy pequeño. Al morir su abuelo, Cónan queda solo en la isla donde habita (a los 11 años, queda solo en la isla), Al quedar completamente solo, Cónan decide buscarse un futuro mejor, y salir de la isla que lo cobijó toda su vida, es aquí donde su vida da un gran giro, al conocer a Lana, quien se convertiría en su mejor amiga. Lana es perseguida por los militares de Isla Industria, comandad por el malvado comandante Lepra, ya que su abuelo, el Dr Lao (científico que ayudo a desarrollar la energía solar, que destruyo el mundo el año 2008) conoce el secreto de la energía solar, y con este conocimiento hacer andar armas mortíferas, y así conquistar el mundo.
